専門ではないですが考察してみましょう。

花札の歴史を見てみると、誕生したのは江戸時代。庶民の娯楽として定着していたようです。

上記の説をざっくり読んでみたのですが……

・花札の源流は元々100枚でできていた「花合せかるた」

　⇒季節ごとに対応した札の数ではない

　⇒「花合わせ」なので様々な植物の図柄が描かれており、その中に紅葉も含まれている

・花合わせかるたの販売元として有名な「松葉屋」の箱には「武蔵野図屏風」の図案（芒に月）

　⇒花合わせかるたに「武蔵野」という俗称が生まれる

　⇒武蔵野＝京都から見た江戸

　　⇒江戸城から見えるであろう12の植物を抜き出して「花札」としたのではないか（推測）

つまり、季節の方が後から割り当てられたようです。

続いて「10月と紅葉」はおかしいかというと、実はそうでもないようです。

「1800年代の紅葉の見頃は（新暦で）11月上旬」という計算結果が出ています。

これを旧暦で計算すると9月末～10月頭となりますので、江戸時代の感覚としてもだいたい10月として問題ないのではないでしょうか。

庶民の娯楽であった花札に、同じく庶民の旅行先として紅葉狩りも人気があったようですから、その辺りは実情に合わせたのかもしれませんね。